CLB này hiện gặp khó khăn tài chính nghiêm trọng khi tài khoản bị phong tỏa do nhà tài trợ cũ nợ thuế, dẫn đến việc nhà tài trợ mới không thể chuyển tiền lương suốt ba tháng qua. Hiện tại, các cầu thủ của đội bóng này cũng bị nợ đến 10 tỷ đồng tiền lót tay.
Theo lịch thi đấu, cuối tuần này CLB Khánh Hòa sẽ chạm trán CLB Quảng Nam ở vòng 23 V.League 2023-2024, nhưng tình hình hiện tại khiến khả năng ra sân của Khánh Hòa trở nên không chắc chắn.
Nếu CLB Khánh Hòa thực sự bỏ giải, V.League sẽ chứng kiến một sự xáo trộn lớn. Chiếu theo điều lệ giải, thành tích của đội Khánh Hòa sẽ bị xóa, và kết quả đối đầu với Khánh Hòa của các đội còn lại sẽ không được tính đến.
Cụ thể, việc CLB Khánh Hòa bỏ giải sẽ khiến cục diện bảng xếp hạng V.League thay đổi rõ rệt. Đội đầu bảng Nam Định sẽ bị trừ 3 điểm (do thắng Khánh Hòa ở trận lượt đi), còn 40 điểm. Đội nhì bảng Bình Định sẽ bị trừ 4 điểm (do thắng 1, hòa 1), còn 33 điểm. Đội hạng ba Hà Nội sẽ bị trừ tới 6 điểm (do thắng cả 2 trận gặp Khánh Hòa), còn 30 điểm. Đội hạng tư Bình Dương cũng bị trừ 6 điểm, chỉ còn 27 điểm. Đội hạng năm Thể Công Viettel bị trừ 4 điểm, còn 29 điểm. Đội hạng sáu Hải Phòng bị trừ 6 điểm, còn 26 điểm. Đội hạng bảy TP.HCM bị trừ 3 điểm, còn 29 điểm. Đội hạng tám Công an Hà Nội bị trừ 3 điểm, còn 28 điểm.
Với sự thay đổi này, vị trí của các đội trên bảng xếp hạng sẽ có sự xáo trộn. CLB Nam Định vẫn giữ vị trí đầu bảng với 40 điểm, xếp sau vẫn là Bình Định (33 điểm) và Hà Nội (30 điểm). CLB Thể Công Viettel vươn lên thứ tư với 29 điểm, theo sau là CLB TP.HCM cũng với 29 điểm, đứng hạng năm. CLB Công an Hà Nội vươn lên hạng sáu với 28 điểm, CLB Bình Dương tụt xuống hạng bảy với 27 điểm, còn Hải Phòng đứng hạng tám với 26 điểm.
Người hâm mộ và các đội bóng đều đang chờ đợi quyết định cuối cùng về số phận của CLB Khánh Hòa, và điều này chắc chắn sẽ ảnh hưởng lớn đến kết quả cuối cùng của mùa giải V.League 2023-2024.