Á quân mùa 1996/97, thua Bayern 2 điểm.
Á quân mùa 1998/99, thua Bayern 15 điểm.
Á quân mùa 1999/2000, thua Bayern hiệu số bàn thắng.
Á quân mùa 2001/02, hơn 1 điểm trước Bayern nhưng thua 1 điểm trước Dortmund.
Á quân mùa 2010/11, hơn Bayern 3 điểm, nhưng vẫn thua Dortmund 7 điểm.
Danh hiệu cao quý nhất của Leverkusen kể từ khi thăng hạng lên chơi ở giải Bundesliga năm 1979 là họ đã giành được UEFA Cup một lần vào năm 1988 và giành cúp Liên đoàn Đức một lần vào năm 1993.
Họ chưa bao giờ xuống hạng kể từ đó đến giờ. Leverkusen đến từ vùng Bắc Rhine-Westphalia nơi đây có các đội bóng tạo nên trận derby gay cấn với Cologne (cách 18 km), Fortuna Düsseldorf (34 km) và Borussia Mönchengladbach (64 km).
Nhưng trong khi đội bóng này đào tạo ra nhiều cầu thủ nổi tiếng và trải qua nhiều HLV hàng đầu, được xem là một trong nhưng CLB lớn nhất tại Bundesliga thế nhưng họ vẫn chưa một lần giành danh hiệu vô địch như mong muốn.
Những cầu thủ hàng đầu này đến, để lại dấu ấn của họ, rồi rời đi. Nhiều người đã trưởng thành và trở thành huyền thoại trong thế giới bóng đá, nhưng nhiều người lại bước vào giai đoạn suy thoái trong sự nghiệp của họ. Những cái tên huyên thoại tại sân BayArena là Dieter Herzog, Thomas Horster, Cha Bum-Kun, Knut Reinhardt, Heiko Herrlich, Franco Foda, Ulf Kierstenn, Brandt Schuster, Paolo Sergio, Rudy Voller, Hans-Peter Lehnhoff, Carsten Ramelow, Jens Novotny, Nico và Robert Kovac.
Mùa giải 1987/88 rực rỡ của Bayer Leverkusen với chức vô địch UEFA Cup.
Và cũng như những HLV xuất sắc, họ đến tạo ra thành công, được yêu mến và rồi họ rời đi. Một số người im lặng, một số tiếp tục tiến triển, và một số người gần như làm nên lịch sử cho câu lạc bộ. Nhưng tất cả họ đều kết thúc với cùng một số phận là không thành công.
Năm năm á quân của Leverkusen dưới sự dẫn dắt của Christoph Doym 3 lần (1996/97, 1998/99, 1999/2000), Klaus Topmöller 1 lần (2001/02) và Jupp Heynckes vào mùa giải 2010/11.
Trong khi đó các đội bóng hàng xóm cùng vùng Rhine-Westphalia như Cologne đã giành 2 chức vô địch, Gladbach đã giành 5 lần vào thập kỷ 1970.
Nhiều người vẫn nhớ như in mùa giải 1999/2000. Đó là thời điểm gần nhất mà Leverkusen đã có cơ hội. Đội của Christoph Doym chơi rất hay sau khi đạt được vị trí thứ hai Bundesliga hai lần trong ba mùa trước đó. Đội có sự kết hợp hoàn hảo giữa sự tươi trẻ và kinh nghiệm.
Bayer Leverkusen dưới bàn tay của Xabi Alonso đang thể hiện sức mạnh tuyệt vời, họ đã thi đấu 26 trận ở tất cả các giải đấu, giành 23 chiến thắng, hòa 3 trận, chưa thua trận đấu nào và ghi được 82 bàn.
Từ mùa giải 1999/2000 đến mùa giải 2001/02 và đến mùa giải 2023/24. Từ Christophe Dom đến Klaus Toppmoller rồi đến Xabi Alonso. Người hâm mộ đội bóng đang mong đợi Xabi Alonso sẽ là HLV đầu tiên mang về chức vô địch Bundesliga cho CLB, chúng tôi chắc chắn rằng ông sẽ được công nhận là một huyền thoại.